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在生命健康领域,人工(gong)智能(AI)模型正(zheng)开始大展身手。AI可以协助医生看影像报告、分析(xi)病情,也可以帮助科研人员总结海量(liang)论文、预测疾病机制(zhi)、加速药物研发。随着Deepseek这(zhe)样性(xing)能强劲的开源大模型面世,生命健康行业迎来“风口(kou)”,从业者可以用更(geng)低的成本开发更(geng)好(hao)的商(shang)业产品。
大模型在生命健康领域如何应用?有何机遇与挑战?2月(yue)21日,在上(shang)海全球开发者先锋大会的“开源语言大模型与AI for Science在生命健康领域的介绍与应用”工(gong)作坊中(zhong),多名(ming)AI专(zhuan)家和产品开发者就这(zhe)些问题展开探讨。
“开源语言大模型与AI for Science在生命健康领域的介绍与应用”工(gong)作坊现场
大模型:从通(tong)用到专(zhuan)业
为(wei)什么“能聊天”的大模型也能够应用在生命科学研究、医学诊疗的各个(ge)环节?工(gong)作坊中(zhong),几位演讲者介绍了AI大模型的原理。它的核心在于模型通(tong)过学习大量(liang)真实数据,理解数据的概率(lu)分布,从而作出(chu)逼近现实的预测。
“如果要在‘我’和‘你’之间填空,应该(gai)怎么填?在武侠(xia)小(xiao)说里(li)可能‘打’出(chu)现得比较多,而在爱情小(xiao)说里(li)可能‘爱’出(chu)现得多。语言大模型可以预测在不同语境(jing)中(zhong),填哪个(ge)字的可能性(xing)最高。”上(shang)海达威(wei)科技创始人朱代辉介绍道。
在目前大模型广(guang)泛(fan)采用的Transformer架构中(zhong),输入的文本会被转化成数学向(xiang)量(liang)的形式,词与词的关联概率(lu)可以用向(xiang)量(liang)距离来度(du)量(liang)。模型比较这(zhe)些向(xiang)量(liang),计算(suan)出(chu)它们之间的“注(zhu)意力权重”,从而确定哪些词对当(dang)前词更(geng)重要,这(zhe)就是(shi)“自注(zhu)意力”(Self-Attention)算(suan)法机制(zhi)。
“这(zhe)种(zhong)机制(zhi)允许模型在处理序列(lie)数据时,同时考(kao)虑所(suo)有位置(zhi)的信息(xi),动态地决定哪些信息(xi)更(geng)重要。”朱代辉说。为(wei)了让模型在不同的上(shang)下文中(zhong)捕捉不同的信息(xi),Transformer模型会将注(zhu)意力权重维度(du)分成多组(zu)同时计算(suan),每组(zu)关注(zhu)序列(lie)中(zhong)的不同部分,最后的结果会被合(he)并。这(zhe)种(zhong)“多头注(zhu)意力”(Multi-Head Attention)机制(zhi)能帮助模型从多个(ge)角度(du)理解句(ju)子(zi)。
这(zhe)些注(zhu)意力权重随后会被输入“前馈神经网(wang)络(luo)”(Feed-Forward Neural Network)中(zhong)进行计算(suan)。这(zhe)种(zhong)神经网(wang)络(luo)模型由多层(ceng)对应数据特征(zheng)的节点构成,它能够帮助模型对数据进行“深度(du)学习”,发现其(qi)中(zhong)更(geng)复(fu)杂的模式。
这(zhe)些模块层(ceng)层(ceng)堆叠,产生大量(liang)参数来描述数据。通(tong)过调整,这(zhe)些模型不止能够学习语言,还能够学习图像、音频(pin)乃至DNA序列(lie)、蛋白质结构等不同模态的数据,将它们进行统一表示。当(dang)参数和数据量(liang)达到一定规模时,模型就仿佛“开窍”一般(ban),涌现出(chu)分类、预测、生成的能力。
要达到这(zhe)种(zhong)效果需要耗费大量(liang)的数据和算(suan)力成本。专(zhuan)注(zhu)于应用的开发者可以选择在这(zhe)些已经具备一定认知能力的通(tong)用大模型基础上(shang)进行算(suan)法和数据的调整,开发适用于特定任务的专(zhuan)业大模型。
联合(he)利华数据AI总监、计算(suan)生物学博士杨荟介绍了Biobert、SCGPT、Evo等多款生命科学和医学领域的大模型,可以用于基因、蛋白质等多组(zu)学信息(xi)的整合(he)、药物靶点发现与分子(zi)设计、医学图像分析(xi)等场景。
能看文献,能做研究,也能诊断
杨荟提到,大模型已经成为(wei)辅助生命科学和医学研究的得力助手。
“一天我看到家里(li)的塑料袋被一些虫子(zi)分泌的物质所(suo)腐蚀,突然来了灵感,就通(tong)过Chatgpt的Deep research(深度(du)研究)功(gong)能询(xun)问有没有昆虫分泌蛋白质降解塑料的研究。AI最后帮我找(zhao)到了西班牙的一项研究,其(qi)中(zhong)发现一种(zhong)飞蛾幼虫能分泌两种(zhong)能够降解塑料的蛋白质。”他说。
随后,杨荟通(tong)过AI提供的资料找(zhao)到了这(zhe)两种(zhong)蛋白质在数据库中(zhong)的信息(xi)。“其(qi)中(zhong)一种(zhong)已经被解析(xi),而且可以看到实际结果与蛋白质结构预测AI给出(chu)的结果很接近。”
一名(ming)开发者还介绍了一款在医学和生物领域相当(dang)流行的AI产品“txyz”。这(zhe)款基于Chatgpt开发的平台能够帮助用户快速查找(zhao)和精读论文,或(huo)是(shi)根据论文形成准确的综合(he)性(xing)回答,帮助科研人员快速获取知识(shi)。
AI大模型快速“理解”文献的能力还可以用于从海量(liang)论文中(zhong)提取关于生命和疾病规律的关键结论,比如药物作用的靶点、疾病机制(zhi)等,然后再用这(zhe)些信息(xi)和其(qi)它实验数据去建(jian)立能够预测生命和疾病活动的模型。这(zhe)被一些人称为(wei)生命的“数字孪生”(digital twin)。
“近年(nian)来尽(jin)管科技进步了,数据也越来越多,药物研发的成功(gong)率(lu)却在走低,主要原因是(shi)对药理机制(zhi)理解的缺乏。”焕一生物的副总裁(cai)蔡俊(jun)杰告诉澎(peng)湃(pai)科技。数字孪生能够通(tong)过模拟人体对药物的反应,从病理的角度(du)对实验结果进行预测,让药物研发少走弯路。
开源大模型性(xing)能的提升为(wei)数字孪生产品开发者带来了新的机遇。“公开数据库中(zhong)有3700万篇医学文献,我们算(suan)了一下,如果调用Chatgpt的接口(kou)去提取收集里(li)面的机制(zhi)和参数等知识(shi),要花费几千万乃至上(shang)亿(yi)美元。”蔡俊(jun)杰说,“现在有了性(xing)能同样强劲的开源模型Deepseek,就能显(xian)著降低成本。”
在医学诊断方面,AI大模型也正(zheng)在帮助医生提高效率(lu),甚至取代一部分的工(gong)作。上(shang)海科莫(mo)生医疗科技有限公司的张浩曦分享(xiang)了他们开发的染色体核型分析(xi)AI平台。
在胚胎发育、细胞分裂时,DNA紧密压缩在一起(qi),成为(wei)我们能观测到的染色体,它们的功(gong)能和形态正(zheng)常很重要。“50%的自然流产是(shi)由染色体异常导(dao)致的。而因为(wei)漏检等原因,在每150个(ge)新生儿中(zhong),平均有1个(ge)染色体异常,这(zhe)往往意味着畸形或(huo)者基因病,是(shi)一件很悲伤(shang)的事情。”张浩曦说。
染色体核型分析(xi)是(shi)医生排除染色体异常的主要手段(duan)。人有23对染色体,但在观测时往往不是(shi)成对出(chu)现的。在核型分析(xi)中(zhong),医生需要“看图配对”,再与正(zheng)常的染色体进行对比,看看有没有缺失、重复(fu)等异常现象。
“这(zhe)个(ge)过程周期长,很枯燥(zao),费眼(yan)睛,搞(gao)得医生也很疲劳(lao)。”张浩曦说。科莫(mo)生开发了一种(zhong)核型分析(xi)大模型,帮助医生进行染色体图像的自动识(shi)别、配对和分析(xi)。该(gai)产品已经拿到了四川省的二类医疗器(qi)械证。
“原先28天才能拿的染色体报告,现在在AI的辅助下1天就能出(chu)。”他说,这(zhe)提高了核型检测的效率(lu),降低了成本,放大了医院的诊疗能力。“做得快了,那么除了孕检之外,比如那些可能接触(chu)辐射的高危人群有需要的人也可以去做。”
挑战与风险
生命科学研究要求专(zhuan)业性(xing)和准确性(xing),而医学诊断更(geng)是(shi)直(zhi)接关系到患者的福祉(zhi)。尽(jin)管AI大模型正(zheng)在各个(ge)应用场景中(zhong)迅(xun)速落地,但其(qi)中(zhong)还是(shi)存在着不少风险与挑战,需要开发者和政(zheng)策(ce)标准制(zhi)定者共同面对和克服。
在西湖大学博士研究生燕阳眼(yan)里(li),AI辅助诊断还是(shi)有很多风险的:“如果问一些大模型,孕妇能用什么药,它会提示四环素是(shi)可以使用的,但这(zhe)个(ge)药肯(ken)定不能用。大模型不知道,是(shi)因为(wei)它没学到过。”
他介绍道,在大语言模型中(zhong),数据训练的本质是(shi)去尽(jin)可能地接近训练数据。如果数据完整、准确、质量(liang)高,那么回答的质量(liang)也就高。如果前面出(chu)现错误,就会导(dao)致后续生成中(zhong)错误的累(lei)积,导(dao)致答案(an)失真。
因此,追求更(geng)高质量(liang)的数据成为(wei)AI产品开发者共同关注(zhu)的主题。燕阳认为(wei),很多人对生命健康领域数据的认识(shi)存在误区,导(dao)致产品开发陷(xian)入瓶颈,乃至产生风险。
“有人觉(jue)得有海量(liang)数据就能训练好(hao)模型,数据越多模型性(xing)能越好(hao),这(zhe)是(shi)不对的。”他说。医院数据往往是(shi)非标准化的,比如医嘱、不同设备产生的检测结果等等,难以直(zhi)接用来训练AI模型。有些数据缺乏标注(zhu),这(zhe)些可能会导(dao)致模型学习到的概率(lu)分布偏离真实的医学推(tui)理逻辑(ji)。
“比如说,超过90%的胸片报告只标注(zhu)异常结果,正(zheng)常的话就没有标注(zhu)。那AI可能会学到‘如果没有标注(zhu),则为(wei)正(zheng)常’的逻辑(ji),这(zhe)显(xian)然是(shi)不对的,会导(dao)致误检率(lu)上(shang)升。”燕阳举例道。
由于缺乏更(geng)加完整的医学数据,有些医学AI研究可能会尝试数据“蒸馏”的方法,用ChatGPT等大模型生成数据,然后用这(zhe)些数据来训练自己参数相对较少的模型。这(zhe)样做的好(hao)处是(shi)能让小(xiao)模型逼近大模型的能力,但坏处是(shi)大模型的输出(chu)本身可能存在问题。
“由于通(tong)用的大模型往往缺少医学知识(shi),可能导(dao)致对罕见病等疾病的忽略。小(xiao)模型将这(zhe)些倾向(xiang)作为(wei)‘事实’进行学习,可能会变得‘过度(du)自信’且容易犯错。”他说。
燕阳认为(wei),这(zhe)些问题可以通(tong)过让数据变得更(geng)加完整和专(zhuan)业来解决,比如增加专(zhuan)家标注(zhu)和更(geng)多医学知识(shi),让AI学会“是(shi)什么”和“为(wei)什么”。还可以通(tong)过展示推(tui)理轨迹(CoT)等算(suan)法来完善AI的推(tui)理过程,把自相矛盾或(huo)者错误的逻辑(ji)剔除出(chu)去。
国内首(shou)个(ge)AI安全研究员、美国生命未(wei)来研究所(suo)的朱小(xiao)虎告诉澎(peng)湃(pai)科技,在风险评估(gu)中(zhong),大语言模型已经展现出(chu)了欺骗、避免(mian)自身毁灭、传播对人有害的信息(xi)等问题。“基于专(zhuan)业知识(shi)的医学模型相对会好(hao)很多。但如果这(zhe)些模型是(shi)以通(tong)用大模型为(wei)基座训练的话,底层(ceng)的倾向(xiang)也可能会传递到模型中(zhong)。”他说。
据悉,2025全球开发者先锋大会于2月(yue)21日至2月(yue)23日在上(shang)海举办,主题为(wei)“模塑全球,无限可能”,旨(zhi)在促(cu)进人工(gong)智能产业集群的培(pei)育,推(tui)动基础大模型与算(suan)力、语料、垂类应用场景等人工(gong)智能企业深度(du)融合(he),打造(zao)以开发者为(wei)中(zhong)心的开发者节。