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和谐国际融资租赁申请退款人工客服电话
2025-02-24 06:41:02
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参考消息网2月12日报道据美国(guo)《大众科学》杂志网站1月15日报道,科学家(jia)利用人工智能(AI)创造出全新(xin)的抗蛇毒蛋白质。

报道称(cheng),据世界卫生组织估计,每年有超过10万人被蛇咬伤致死,还有数十万人永久致残(can)。借(jie)助(zhu)尖端技术实(shi)现的前沿科学有望帮助(zhu)减轻(qing)这一威胁。

根据一项1月15日发表在《自然》杂志上(shang)的研究,研究人员利用一套人工智能工具,成功设(she)计出两种蛋白质以中和一些最致命的蛇毒毒素。在实(shi)验室实(shi)验中,将这些“全新(xin)的”蛋白质(自然界中不存在的分子)与致命的蛇毒化合物混合后(hou)注射(she),能避免100%的实(shi)验小鼠死亡。

该研究论文的主(zhu)要作者苏珊娜·巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)说:“我认为,我们可以彻底改变(蛇咬伤的)治疗方法。”巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)是一名生物化学家(jia),她在华盛顿(dun)大学戴维·贝克实(shi)验室攻读博士学位期间完成了(le)这项研究。贝克因创造新(xin)蛋白质而荣获2024年诺贝尔化学奖。本周发表的这项研究是该研究方向的延续。巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)告诉《大众科学》杂志:“当然,这项研究并没有完全解(jie)决问题,但它表明,与传统方法相比,我们能超快速地合成分子,而且这种方法有效。”她还说,这一策略有望带来(lai)比现有的更便宜、更安全且更有效的治疗方案。

斯(si)克里(li)普斯(si)研究所的免疫学与微生物学助(zhu)理教授约瑟夫·贾丁说:“这是了(le)不起(qi)的研究成果。”贾丁未参与这项新(xin)研究,但此前曾发表针对同类化合物合成抗蛇毒血清的研究。他表示,这项新(xin)研究既展示了(le)近年来(lai)在人工智能迅速发展的推动(dong)下,蛋白质设(she)计取得(de)了(le)多大的进展,同时也是医学领域一项令人振奋的实(shi)际进步。

尽管蛇咬伤造成了(le)严重后(hou)果,但一个多世纪以来(lai),蛇咬伤的治疗方法一直未变,仍然是从接(jie)种了(le)亚(ya)致死量蛇毒的马(ma)或其他动(dong)物身上(shang)采集抗体(ti)。这些抗蛇毒血清能挽救生命,但也存在一些严重缺陷。

其一,它们价(jia)格昂贵且制作困难,因为生产过程需要饲(si)养大量动(dong)物。其二,质量参差不齐,由于依赖不完美的免疫系统,产生的效果也不稳定,而且抗蛇毒血清对某些毒素的效果往往优于对其他毒素,因此只能部分中和蛇毒这种复杂混合物中最小的成分,对某些蛇类咬伤的治疗效果不佳(jia)。它们还可能在接(jie)受者身上(shang)引发过敏反应及(ji)其他不良副作用。而且,由于传统抗蛇毒血清是生物制品,对温度非常敏感,储存和运输(shu)都需要冷藏,导致成本更高,也更难获得(de)。在蛇咬伤尤为常见的南半球发展中国(guo)家(jia)的农村地区,这种治疗方法尤其难以获得(de)。

相比之下,新(xin)设(she)计的蛋白质能在更大的温度范围内保持稳定,有望利用酵母等微生物进行大规模生产,引发的副作用可能更少,而且更容(rong)易(yi)进行微调并保持性能稳定。贾丁解(jie)释说:“这些全新(xin)设(she)计的小蛋白质具有许(xu)多十分有趣的优势(shi),包(bao)括(kuo)热稳定性、制造成本较低,能以抗体(ti)可能无(wu)法实(shi)现的方式靶(ba)向特定物质。”他还提出,有朝(chao)一日,这类产品也许(xu)能通过类似“肾上(shang)腺素笔”的装置来(lai)给(gei)药,在最需要的地方随时可用。

蛇毒由多种不同毒素混合而成。巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)及(ji)其同事将研究工作聚焦于三指毒素(3FTx),传统抗蛇毒血清往往难以有效对抗这类致命化合物。三指毒素在眼镜蛇科蛇类的毒液中尤为显(xian)著,该科蛇类包(bao)括(kuo)眼镜蛇、曼巴(ba)蛇和珊瑚蛇。这些毒素(本身就是蛋白质)会在哺乳(ru)动(dong)物体(ti)内大肆破坏。有些是导致瘫痪的神经毒素,另一些则(ze)会破坏细胞(bao)、损伤组织。

科学家(jia)试图找出能对抗三种典型目标毒素的解(jie)毒蛋白质:一种短链α神经毒素、一种长链α神经毒素,以及(ji)一种细胞(bao)毒素。这三种典型毒素都已得(de)到充分研究,所以科学家(jia)从一开始就知道它们的复杂结(jie)构(gou)。基于此,他们能确定要使每种毒素失去活性所需阻断的关(guan)键结(jie)合位点(dian)。他们将这些信息输(shu)入第一个名为“罗塞塔折叠扩散”的人工智能工具中,这是一种类似于达尔-E和米德(de)朱尼实(shi)验室等推出的图像生成器模型,但它经过专门训练,能根据设(she)定的标准(zhun)输(shu)出蛋白质结(jie)构(gou)的模拟图。在这个案例中,设(she)定的标准(zhun)就是毒素结(jie)构(gou)以及(ji)研究人员希望阻断的选(xuan)定结(jie)合“热点(dian)”。人工智能提供了(le)数十种中和蛋白质的建(jian)议(以蛋白质构(gou)型的详细图像形式呈现),这些蛋白质可能填充那些结(jie)合位点(dian),就像为神秘的锁配制钥匙。

为了(le)更深入了(le)解(jie)这些理论上(shang)的蛋白质并解(jie)析其构(gou)成,巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)、贝克及(ji)其他论文作者采用了(le)第二种生成式人工智能模型——ProteinMPNN。该模型经过训练,能生成可行的氨(an)基酸组合,这些氨(an)基酸可以折叠在一起(qi),复制扩散模型的输(shu)出结(jie)果。蛋白质折叠过程极为复杂,通常仅从氨(an)基酸序列很难预测,反之,要知道哪种氨(an)基酸序列会形成何种折叠形状(zhuang)也颇具挑(tiao)战。ProteinMPNN加快了(le)这一计算过程。接(jie)下来(lai),研究人员使用了(le)第三种预测性人工智能工具“阿尔法折叠2”,独立预测每一种氨(an)基酸序列实(shi)际会如何折叠,以此对前两个模型的工作进行双重验证。在每一步之间,研究人员凭借(jie)自身专业视角,筛除不理想的结(jie)果,将候选(xuan)范围缩小至(zhi)最佳(jia)选(xuan)项。

研究人员将最有潜力的氨(an)基酸链反向翻译(yi)为DNA序列,然后(hou)利用经过改造的细菌大量生产这些蛋白质。他们在培养皿中用人的肌肉和皮肤细胞(bao)对最有希望的候选(xuan)蛋白质进行了(le)一系列实(shi)验,发现这些蛋白质对所有三种重点(dian)研究的毒素均有效。这进一步缩小了(le)范围,每个类别只剩下一个最有竞争力的候选(xuan)者。科学家(jia)在一系列小鼠实(shi)验中对这些候选(xuan)者逐一进行了(le)测试。

在最初的测试中,他们的抗细胞(bao)毒素候选(xuan)蛋白质并未减轻(qing)与蛇毒中毒相关(guan)的皮肤损伤,因此研究人员停止了(le)对它的测试。但另外两种候选(xuan)蛋白质被证明效果要好得(de)多。当与目标毒素直接(jie)混合并注射(she)到小鼠体(ti)内时,两种抗神经毒素蛋白质都避免了(le)所有小鼠死亡(如果不添加这些保护蛋白质,100%的小鼠会死亡)。

为了(le)模拟治疗蛇咬伤的过程,科学家(jia)接(jie)着测试了(le)先给(gei)小鼠注射(she)一种毒素,之后(hou)再注射(she)候选(xuan)蛋白质的情况。其中一种蛋白质拯救了(le)接(jie)受注射(she)的所有小鼠,即使在注射(she)毒素30分钟后(hou)给(gei)药依然有效。另一种蛋白质在毒素注射(she)15分钟后(hou)给(gei)药,能使80%的小鼠存活,30分钟后(hou)给(gei)药,存活率为60%。

巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)说:“看到这些蛋白质直接(jie)在动(dong)物身上(shang)发挥(hui)作用,太令人震惊了(le)。我们甚至(zhi)无(wu)需进行任何优化。”她说:“第一次尝试就找到有效的东西,这太不可思(si)议了(le)。”此外,得(de)益于人工智能的计算助(zhu)力,这项研究从提出想法到提交发表数据,仅仅用了(le)大约一年。“我觉得(de)这对任何科学论文而言,都是创纪录的速度。”她说,这充分展示了(le)机器学习能在多大程度上(shang)加速研究进程。

这些研究成果只是近期抗蛇毒血清研究一系列新(xin)进展(比如贾丁的合成抗体(ti),以及(ji)重新(xin)利用的药物)中的最新(xin)成果。2017年,世界卫生组织将蛇咬伤列为“被忽(hu)视热带疾病”并将其作为重点(dian),呼吁加大投资并提升公共(gong)卫生关(guan)注度。此后(hou),相关(guan)研究源源不断。贾丁说:“这为我们解(jie)决问题又增加了(le)一种工具。(这些蛋白质)将具有抗体(ti)不具备的独特应用,反之亦然。”

然而,在全新(xin)设(she)计的蛋白质获批(pi)用于人体(ti)之前,还有很长的路要走。虽然小鼠实(shi)验没有显(xian)示出任何明显(xian)的副作用,但这些蛋白质在人体(ti)内的作用方式以及(ji)它们是否真的安全,仍不得(de)而知。巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)和贾丁都指出,它们是全新(xin)的分子,需要针对脱靶(ba)反应和不良反应进行广泛(fan)的筛选(xuan)与测试。巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)说:“我们需要证明这些分子是安全的。我们必须(xu)真正了(le)解(jie)它们的作用机制。”任何一种经设(she)计的蛋白质抗蛇毒血清要进入市场,都还需要很多很多年。

即使真的进入市场,巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)及(ji)其同事发现的这些蛋白质也还不够。它们只能应对特定蛇毒中的两种特定毒素。巴(ba)斯(si)克斯(si)·托雷斯(si)说,可能需要将大约十种精心设(she)计的蛋白质混合在一起(qi),才能中和全部蛇毒。在寻找广谱(pu)或通用抗蛇毒血清的道路上(shang),科学家(jia)仍在探索。

尽管如此,利用微生物按(an)需大量生产自然界中原(yuan)本不存在的全新(xin)蛋白质,这一前景让科学家(jia)兴奋不已。而且这种兴奋并不局限于抗蛇毒血清领域。有朝(chao)一日,全新(xin)设(she)计的蛋白质或许(xu)能为各(ge)类疾病带来(lai)替代性疗法。这些氨(an)基酸构(gou)成的物质介于生物药(从生物体(ti)中制造或提取)与阿司匹(pi)林这类小分子化学合成药之间。贾丁说:“你可以想象,这能解(jie)决大量用传统方法无(wu)法解(jie)决的问题。这是一种全新(xin)的策略,而我们才刚(gang)刚(gang)触及(ji)皮毛。”(编译(yi)/刘白云)

2016年5月17日,在泰国(guo)曼谷梭瓦帕王后(hou)纪念研究所内设(she)的蛇类博物馆,一名工作人员为参观者演示取蛇毒。(新(xin)华社)

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