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想(xiang)知道一(yi)片水域(yu)里有多少鱼,不(bu)用撒网捕捞,只(zhi)需取一(yi)瓢水就能(neng)算出……上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康(kang)评估工程中心李晨虹(hong)团队在国际知名期刊(kan)《分(fen)子生态资源(yuan)》(Molecular Ecology and Resources)上发表了题为 “Estimation of SpeciesAbundance Based on the Number of Segregating Sites Using Environmental DNA (eDNA)” 的封面文章,为环境DNA(eDNA)定量技术的应用提供了新思路,未来(lai)或可(ke)让生态监测像“查指(zhi)纹”一(yi)样高效。
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“凡是生物存在过的地方就会留下(xia)它们的痕迹。同(tong)样,鱼游过也会在水中留下(xia)DNA‘痕迹’。”李晨虹(hong)教授(shou)介绍(shao),eDNA是指(zhi)生物体(ti)释放至体(ti)外环境(包(bao)括(kuo)水体(ti)、土壤、空气等)中的DNA片段。其来(lai)源(yuan)广泛,一(yi)方面源(yuan)于生物皮肤、鳞片受损(sun)导致的细胞脱(tuo)落,另(ling)一(yi)方面则来(lai)自(zi)生物在呼吸、排泄、繁殖(zhi)等正常生理(li)活动中释放的DNA。
借助eDNA进行生物监测,是一(yi)种高效、灵敏且对生物无损(sun)伤的技术手段,在生物多样性(xing)评估、濒(bin)危物种保护以及入(ru)侵生物监测等领域(yu)展(zhan)现出了巨(ju)大的应用潜力。
以往eDNA技术一(yi)直有个“痛(tong)点”:它能(neng)判(pan)断“有没有鱼”,却很难说清楚“有多少鱼”,诸多因素(su)会影响eDNA 浓(nong)度,难以获得准确(que)可(ke)靠(kao)的定量结果。
为此,李晨虹(hong)教授(shou)带领团队另(ling)辟蹊径。“我们可(ke)以从基因序(xu)列差异(yi)的角度来(lai)探(tan)讨eDNA与物种数量之间(jian)的关系。”李晨虹(hong)进一(yi)步说明,假(jia)设环境中仅存在一(yi)个个体(ti),无论其释放的DNA浓(nong)度高低,其DNA序(xu)列都是固定的。当存在两个个体(ti)时(shi),它们的DNA序(xu)列会出现一(yi)定程度的差异(yi);若存在三个个体(ti),序(xu)列差异(yi)则会进一(yi)步增大。“这就好比一(yi)家人的指(zhi)纹各不(bu)相(xiang)同(tong),若在某地检测到10种不(bu)同(tong)指(zhi)纹,就能(neng)推测至少有10个人来(lai)过。”
团队开发的基于分(fen)离位(wei)点数的eDNA定量方法,其优势在于不(bu)受物种体(ti)型、摄食行为等环境变量的干扰,能(neng)够更(geng)加稳定、精准地评估目标(biao)物种的数量。李晨虹(hong)说,“无论鱼在吃饭、休息,都不(bu)影响差异(yi)点数量,这就可(ke)以让生态监测更(geng)高效。”
研究的发现为eDNA技术的定量分(fen)析(xi)提供了一(yi)种新的思路,有望提升eDNA在物种监测、生态评估及生物多样性(xing)研究中的应用精度。未来(lai)研究可(ke)进一(yi)步拓展(zhan)至更(geng)广泛的生境和目标(biao)物种,以验(yan)证该方法的适用性(xing),并优化其在实际生态监测中的应用策略。
来(lai)源(yuan):上海杨浦(pu)