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朝天椒的果(guo)实为何向上(shang)生长?甜椒本来就没有辣味吗?近日,一项新的研究,构建了野生和栽培辣椒的高质量基因组图谱,揭开了辣椒性状演化奥秘。该研究由中国农(nong)业科学院蔬菜花(hua)卉研究所(以(yi)下(xia)简称“蔬菜花(hua)卉所”)科研团队完成,相关成果(guo)以(yi)封(feng)面论文形式刊登在《自然(ran)·植物》上(shang)。
辣椒是我国播(bo)种(zhong)面积最大的蔬菜作物之一,年种(zhong)植面积超(chao)2000万亩(mu)。辣椒属包含30多个种(zhong),包括广泛栽培的一年生辣椒等5个栽培种(zhong)和众多野生种(zhong),遗传多样性丰富,但演化路线尚不明确。
论文通(tong)讯作者、蔬菜花(hua)卉所研究员程锋介绍,利用新型测序技术,科研人员完成了5个栽培种(zhong)及(ji)6个野生种(zhong)的高质量组装,其中两个基因组实现了“端粒到端粒”的完成图,从而找到了破解辣椒家族生命演化的密(mi)码。
辣椒祖(zu)先有多少染色体?学界一直没有定论。得(de)益于多个高质量基因组图谱,科研人员通(tong)过重建辣椒属的祖(zu)先模型,明确了其原始核型为12对(dui)染色体。转座子被称为“基因组活跃分(fen)子”,进一步研究还发现,不同辣椒基因组中的转座子爆发事(shi)件有明显(xian)差异(yi)。这些转座子引发了大量的基因组结构变(bian)异(yi),直接(jie)参与塑造辣椒的多样性表型。例(li)如,中国辣椒的果(guo)实主要为朝下(xia),然(ran)而,调控果(guo)实朝向基因的启(qi)动子区域出现了缺失,改变(bian)了基因表达,使得(de)一些辣椒果(guo)实从朝下(xia)变(bian)为朝上(shang)。
通(tong)过构建完整的辣椒单体型图谱,科研人员还发现,一年生辣椒通(tong)过“基因借力”不断优化性状。比(bi)如,通(tong)过与姊妹物种(zhong)灌(guan)木辣椒杂(za)交,丰富了遗传多样性;部分(fen)甜椒引入中国辣椒的抗病基因以(yi)抵御辣椒轻斑驳病毒;通(tong)过逐步选择辣味Pun1基因的特(te)定单体型,实现了从辛辣到甜美的转变(bian)。“这些发现如同绘制(zhi)了辣椒育(yu)种(zhong)的‘导(dao)航图’,为提升优良品(pin)种(zhong)选育(yu)效率提供了新思路。”论文共同通(tong)讯作者、蔬菜花(hua)卉所研究员王立浩(hao)说。
“这项研究有力展示了我国辣椒领域的原始创新能(neng)力。”辣椒育(yu)种(zhong)专(zhuan)家、中国工程院院士(shi)邹学校认为,成果(guo)对(dui)于推动辣椒育(yu)种(zhong)从“经(jing)验驱动”到“数据(ju)驱动”的转型具有重要指导(dao)意义。