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想知道(dao)一片水域里有多少(shao)鱼(yu),不用撒网捕捞,只需取一瓢水就能算出……上海海洋大学环境DNA技术(shu)与水生态健康评估工程(cheng)中心李晨虹(hong)团队在国际(ji)知名期刊《分子(zi)生态资(zi)源(yuan)》(Molecular Ecology and Resources)上发表了题为 “Estimation of SpeciesAbundance Based on the Number of Segregating Sites Using Environmental DNA (eDNA)” 的封面文章,为环境DNA(eDNA)定量技术(shu)的应用提供了新思路,未来(lai)或可(ke)让生态监测像“查指纹”一样高效。
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“凡是生物存在过的地方就会留下它们的痕迹(ji)。同样,鱼(yu)游(you)过也会在水中留下DNA‘痕迹(ji)’。”李晨虹(hong)教(jiao)授介绍,eDNA是指生物体(ti)释放至体(ti)外环境(包(bao)括水体(ti)、土壤、空气等)中的DNA片段。其来(lai)源(yuan)广(guang)泛,一方面源(yuan)于生物皮肤、鳞片受损导致的细(xi)胞脱(tuo)落,另一方面则来(lai)自生物在呼吸、排泄、繁殖等正常生理活动中释放的DNA。
借助eDNA进行生物监测,是一种高效、灵敏且对生物无损伤的技术(shu)手段,在生物多样性评估、濒危(wei)物种保护以及入侵生物监测等领域展现出了巨大的应用潜力。
以往eDNA技术(shu)一直有个“痛点”:它能判断“有没(mei)有鱼(yu)”,却很难说清楚“有多少(shao)鱼(yu)”,诸多因素(su)会影响eDNA 浓度,难以获得准(zhun)确可(ke)靠的定量结果。
为此,李晨虹(hong)教(jiao)授带(dai)领团队另辟蹊(qi)径。“我(wo)们可(ke)以从基因序列差异的角度来(lai)探讨eDNA与物种数量之间的关系。”李晨虹(hong)进一步说明,假设环境中仅存在一个个体(ti),无论其释放的DNA浓度高低,其DNA序列都是固定的。当存在两个个体(ti)时,它们的DNA序列会出现一定程(cheng)度的差异;若存在三个个体(ti),序列差异则会进一步增大。“这就好比一家人的指纹各不相同,若在某地检测到10种不同指纹,就能推测至少(shao)有10个人来(lai)过。”
团队开发的基于分离位(wei)点数的eDNA定量方法,其优(you)势在于不受物种体(ti)型(xing)、摄(she)食行为等环境变量的干扰,能够更加稳定、精(jing)准(zhun)地评估目标物种的数量。李晨虹(hong)说,“无论鱼(yu)在吃饭、休息,都不影响差异点数量,这就可(ke)以让生态监测更高效。”
研究的发现为eDNA技术(shu)的定量分析提供了一种新的思路,有望提升eDNA在物种监测、生态评估及生物多样性研究中的应用精(jing)度。未来(lai)研究可(ke)进一步拓展至更广(guang)泛的生境和目标物种,以验(yan)证(zheng)该(gai)方法的适用性,并优(you)化其在实际(ji)生态监测中的应用策略。
来(lai)源(yuan):上海杨(yang)浦