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想知道(dao)一片水域里有多少鱼,不(bu)用撒网捕捞,只需取一瓢水就能算出……上海海洋大(da)学环境DNA技(ji)术与水生态健康(kang)评估(gu)工程中心李晨虹团队在国际(ji)知名期刊《分子生态资源》(Molecular Ecology and Resources)上发(fa)表了题为 “Estimation of SpeciesAbundance Based on the Number of Segregating Sites Using Environmental DNA (eDNA)” 的封面文章,为环境DNA(eDNA)定量技(ji)术的应用提供(gong)了新思路,未来或可让生态监测像“查指纹”一样高效(xiao)。
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“凡是生物存(cun)在过的地方就会留(liu)下它们的痕迹。同样,鱼游过也会在水中留(liu)下DNA‘痕迹’。”李晨虹教授(shou)介绍(shao),eDNA是指生物体释(shi)放(fang)至体外环境(包括水体、土壤、空气等(deng))中的DNA片段。其来源广泛,一方面源于(yu)生物皮肤、鳞片受(shou)损导致(zhi)的细(xi)胞脱落,另一方面则来自生物在呼吸、排泄、繁殖等(deng)正常(chang)生理活动中释(shi)放(fang)的DNA。
借助(zhu)eDNA进行生物监测,是一种高效(xiao)、灵敏(min)且对生物无损伤的技(ji)术手段,在生物多样性评估(gu)、濒(bin)危物种保(bao)护以及(ji)入侵生物监测等(deng)领域展现出了巨(ju)大(da)的应用潜力。
以往eDNA技(ji)术一直有个“痛点”:它能判断“有没(mei)有鱼”,却很难(nan)说清楚“有多少鱼”,诸多因素会影响eDNA 浓(nong)度(du),难(nan)以获得准确可靠的定量结果。
为此,李晨虹教授(shou)带领团队另辟蹊径(jing)。“我们可以从基因序列差(cha)异的角度(du)来探讨(tao)eDNA与物种数量之间(jian)的关(guan)系。”李晨虹进一步说明(ming),假设(she)环境中仅(jin)存(cun)在一个个体,无论其释(shi)放(fang)的DNA浓(nong)度(du)高低(di),其DNA序列都(dou)是固(gu)定的。当存(cun)在两个个体时,它们的DNA序列会出现一定程度(du)的差(cha)异;若(ruo)存(cun)在三个个体,序列差(cha)异则会进一步增(zeng)大(da)。“这就好(hao)比一家人的指纹各不(bu)相同,若(ruo)在某地检测到10种不(bu)同指纹,就能推测至少有10个人来过。”
团队开发(fa)的基于(yu)分离位(wei)点数的eDNA定量方法(fa),其优势在于(yu)不(bu)受(shou)物种体型、摄食(shi)行为等(deng)环境变量的干扰,能够更加稳(wen)定、精准地评估(gu)目标物种的数量。李晨虹说,“无论鱼在吃饭、休息,都(dou)不(bu)影响差(cha)异点数量,这就可以让生态监测更高效(xiao)。”
研究(jiu)的发(fa)现为eDNA技(ji)术的定量分析提供(gong)了一种新的思路,有望提升eDNA在物种监测、生态评估(gu)及(ji)生物多样性研究(jiu)中的应用精度(du)。未来研究(jiu)可进一步拓展至更广泛的生境和(he)目标物种,以验证该方法(fa)的适(shi)用性,并(bing)优化其在实际(ji)生态监测中的应用策略。
来源:上海杨浦