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北京时间2025年2月21日,国际学术期刊《科学》杂志(zhi)发表了华中农(nong)业(ye)大学韩文(wen)元教授团队题为“Base-modified nucleotides mediate immune signaling in bacteria(碱基修饰核苷酸介导细菌免疫信(xin)号通路)”的研究成果(guo)。该成果(guo)揭示了一(yi)种以碱基修饰核苷酸为第(di)二信(xin)使的细菌抗噬(shi)菌体(病毒(du))免疫信(xin)号通路,称之为“孔明系统”(Kongming),该机(ji)制通过“借用”噬(shi)菌体自身成分激活(huo)免疫反应,为理解(jie)微生物间的生存(cun)博弈开辟了新视角。
在微观世界里,细菌与病毒(du)之间每天都在上演着(zhe)攻防大战。生物体内的信(xin)号传递如同精密的通信(xin)网络,而核苷酸分子长期被认为是关(guan)键的“信(xin)号兵”。自1950年代发现环状(zhuang)核苷酸(如cAMP、cGMP)以来,科学家已解(jie)析了其在代谢调节、免疫应答中的核心作(zuo)用,相关(guan)研究多次获得诺贝尔奖。不(bu)同于环状(zhuang)核苷酸的免疫作(zuo)用,非典(dian)型核苷酸在过去普通被认为不(bu)发挥任何生理作(zuo)用。然而,研究团队通过基因分析,锁定了一(yi)个由KomA(孔明A)、KomB(孔明B)、KomC(孔明C)三个蛋白组成的防御系统。当噬(shi)菌体入侵时,其携带的脱(tuo)氧核苷酸激酶(DNK)意外成为激活(huo)细菌免疫的“开关(guan)”:KomA与DNK协作(zuo),将核苷酸(dAMP)转(zhuan)化为特殊信(xin)号分子dITP。这(zhe)种分子能触发KomC蛋白分解(jie)细胞内的关(guan)键物质NAD⁺,导致噬(shi)菌体因“能源枯竭”无法复制。令(ling)人称奇的是,该系统巧妙利用入侵者携带的酶完成防御,正如三国时期诸葛亮“草船借箭(jian)”的智谋,因此被命名为“孔明系统”。这(zhe)种碱基修饰核苷酸的信(xin)号传导模(mo)式突破了环状(zhuang)核苷酸作(zuo)为信(xin)号分子的经典(dian)理论体系,首次证实非典(dian)型核苷酸同样具有免疫调控功能。
△孔明信(xin)号通路的免疫机(ji)制(左侧)和噬(shi)菌体的免疫逃逸机(ji)制(右侧)
研究显示,“孔明系统”广泛存(cun)在于各类细菌中,其模(mo)块化结构(核心KomB-KomC搭配可变KomA)提示自然界可能存(cun)在更多未知的核苷酸信(xin)号系统。该发现不(bu)仅为细菌免疫研究提供新方(fang)向(xiang),其特异性(xing)识别dITP的特性(xing)更具备医学应用潜力:未来或可开发便携式核苷酸检测工具,助力遗传代谢病(如ADA缺乏症)诊断及抗癌(ai)药物疗效监(jian)测,突破现有检测技术依赖大型仪器的局限(xian)。
△本(ben)研究(蓝框)与经典(dian)免疫信(xin)号通路的比较
编辑/胡克青