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朝天椒的果实为(wei)何向上生长？甜椒本来就没有辣味(wei)吗？近日，一项(xiang)新的研(yan)究(jiu)，构建(jian)了野生和栽培辣椒的高质量基因组图谱，揭开了辣椒性状演化奥(ao)秘。该研(yan)究(jiu)由中国农业科学院蔬菜(cai)花卉研(yan)究(jiu)所（以下简(jian)称“蔬菜(cai)花卉所”）科研(yan)团队完(wan)成，相关成果以封面论文形式刊登在《自(zi)然(ran)·植物》上。
辣椒是我国播种面积最大的蔬菜(cai)作物之一，年种植面积超2000万(wan)亩。辣椒属包含30多个种，包括广泛栽培的一年生辣椒等(deng)5个栽培种和众多野生种，遗传多样性丰(feng)富，但演化路线尚不明确。
论文通讯作者、蔬菜(cai)花卉所研(yan)究(jiu)员程锋介绍，利用新型测序技术，科研(yan)人员完(wan)成了5个栽培种及6个野生种的高质量组装，其中两个基因组实现了“端粒到端粒”的完(wan)成图，从(cong)而找到了破解(jie)辣椒家族生命演化的密码。
辣椒祖先有多少(shao)染色体？学界一直没有定论。得益于(yu)多个高质量基因组图谱，科研(yan)人员通过重(zhong)建(jian)辣椒属的祖先模型，明确了其原始核型为(wei)12对染色体。转座(zuo)子被称为(wei)“基因组活(huo)跃(yue)分(fen)子”，进一步研(yan)究(jiu)还(hai)发现，不同(tong)辣椒基因组中的转座(zuo)子爆发事(shi)件有明显差异。这(zhe)些转座(zuo)子引发了大量的基因组结构变(bian)异，直接参与(yu)塑造辣椒的多样性表型。例如，中国辣椒的果实主要为(wei)朝下，然(ran)而，调控果实朝向基因的启动子区域出现了缺失，改变(bian)了基因表达，使得一些辣椒果实从(cong)朝下变(bian)为(wei)朝上。
通过构建(jian)完(wan)整(zheng)的辣椒单体型图谱，科研(yan)人员还(hai)发现，一年生辣椒通过“基因借力”不断优化性状。比如，通过与(yu)姊妹物种灌木辣椒杂交，丰(feng)富了遗传多样性；部(bu)分(fen)甜椒引入(ru)中国辣椒的抗病(bing)基因以抵御辣椒轻斑驳(bo)病(bing)毒；通过逐步选择辣味(wei)Pun1基因的特定单体型，实现了从(cong)辛辣到甜美的转变(bian)。“这(zhe)些发现如同(tong)绘制了辣椒育种的‘导航图’，为(wei)提升优良品种选育效(xiao)率提供了新思路。”论文共同(tong)通讯作者、蔬菜(cai)花卉所研(yan)究(jiu)员王(wang)立(li)浩说。
“这(zhe)项(xiang)研(yan)究(jiu)有力展示了我国辣椒领域的原始创(chuang)新能力。”辣椒育种专家、中国工程院院士(shi)邹(zou)学校认为(wei)，成果对于(yu)推动辣椒育种从(cong)“经验驱动”到“数据驱动”的转型具有重(zhong)要指导意义。